Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB4A4D0S4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms