Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM89A2RUT3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms