Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms