Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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