Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH4-201ENST00000263187 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS3-201ENST00000390652 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2S1-201ENST00000256383 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMP5-201ENST00000246070 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRDL2-201ENST00000263671 1712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CATSPER1-201ENST00000312106 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CD79B-202ENST00000349817 378 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079612.1-201ENST00000358775 3700 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7E-201ENST00000362102 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD3G-201ENST00000362796 215 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PALM2-202ENST00000374531 4492 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APOM-203ENST00000375920 709 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR200B-201ENST00000384997 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DRD1-201ENST00000393752 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-6-201ENST00000400368 1238 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C22orf15-203ENST00000402217 829 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CR786580.1-201ENST00000417843 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BANF1P4-201ENST00000420029 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012354.2-201ENST00000423051 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms