Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC104619.3-201ENST00000509116 1387 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC025062.1-201ENST00000465163 644 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC156455.1-202ENST00000540968 587 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC113349.2-201ENST00000607804 377 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 NOS2-202ENST00000621962 3345 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 DCX-201ENST00000356220 3019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 DAB2-201ENST00000320816 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 VPS4B-201ENST00000238497 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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CNKSR2Q8WXI2 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL136529.1-201ENST00000430540 610 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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CNKSR2Q8WXI2 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 AL139220.2-217ENST00000609027 940 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 UTP15-202ENST00000508491 1828 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CNKSR2Q8WXI2 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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