RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.57□□□□□ -0.08
RNU6-677P-201ENST00000516914 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.91□□□□□ -0.5
RNU6-677P-201ENST00000516914 FOXD1Q16676 465 aa11.49□□□□□ -0.57
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.25□□□□□ -0.61
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADRA2BP18089 450 aa11.23□□□□□ -0.61
RNU6-677P-201ENST00000516914 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCNA4P22459 653 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-677P-201ENST00000516914 MSH5O43196 834 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-677P-201ENST00000516914 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RNU6-677P-201ENST00000516914 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RNU6-677P-201ENST00000516914 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RNU6-677P-201ENST00000516914 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RNU6-677P-201ENST00000516914 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-677P-201ENST00000516914 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-677P-201ENST00000516914 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RNU6-677P-201ENST00000516914 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-677P-201ENST00000516914 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZBTB22O15209 634 aa9.79□□□□□ -0.84
RNU6-677P-201ENST00000516914 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC4A2P04920 1241 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-677P-201ENST00000516914 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RNU6-677P-201ENST00000516914 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.3□□□□□ -0.92
RNU6-677P-201ENST00000516914 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RNU6-677P-201ENST00000516914 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU6-677P-201ENST00000516914 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU6-677P-201ENST00000516914 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEDQ86YR6 584 aa9.11□□□□□ -0.95
RNU6-677P-201ENST00000516914 RNF39Q9H2S5 420 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-677P-201ENST00000516914 APLP2Q06481 763 aa8.99□□□□□ -0.97
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RNU6-677P-201ENST00000516914 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RNU6-677P-201ENST00000516914 FKBP8Q14318 412 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU6-677P-201ENST00000516914 CAPN15O75808 1086 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-677P-201ENST00000516914 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RNU6-677P-201ENST00000516914 POLA2Q14181 598 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-677P-201ENST00000516914 ABCB7O75027 752 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-677P-201ENST00000516914 FBLN2P98095 1184 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-677P-201ENST00000516914 DSG3P32926 999 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-677P-201ENST00000516914 PROM2Q8N271 834 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-677P-201ENST00000516914 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RNU6-677P-201ENST00000516914 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-677P-201ENST00000516914 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-677P-201ENST00000516914 OSCARQ8IYS5 282 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-677P-201ENST00000516914 FBXO3Q9UK99 471 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE6P0CI01 402 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-677P-201ENST00000516914 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-677P-201ENST00000516914 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-677P-201ENST00000516914 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-677P-201ENST00000516914 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-677P-201ENST00000516914 AKT1S1Q96B36 256 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-677P-201ENST00000516914 PKD2Q13563 968 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPOCK2Q92563 424 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-677P-201ENST00000516914 MIER1Q8N108 512 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-677P-201ENST00000516914 KLHL34Q8N239 644 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC24A1O60721 1099 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-677P-201ENST00000516914 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLEKHG5O94827 1062 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-677P-201ENST00000516914 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-677P-201ENST00000516914 PITPNM1O00562 1244 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-677P-201ENST00000516914 CREBZFQ9NS37 354 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-677P-201ENST00000516914 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRR29P0C7W0 189 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-677P-201ENST00000516914 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUBP1P53384 320 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-677P-201ENST00000516914 RGL2O15211 777 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-677P-201ENST00000516914 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-677P-201ENST00000516914 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRIM41Q8WV44 630 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLCB2Q00722 1185 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-677P-201ENST00000516914 GSE1Q14687 1217 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-677P-201ENST00000516914 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 RASEFQ8IZ41 740 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM212AQ96EL1 285 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHADLQ6NUI6 762 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-677P-201ENST00000516914 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms