Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 TAPT1-AS1-203ENST00000573950 510 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CAMK2BQ13554 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CAMK2BQ13554 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms