Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CTPS2-203ENST00000443824 4319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-215ENST00000614135 2942 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSB-201ENST00000353609 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7I-201ENST00000362309 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR219A2-202ENST00000385220 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV1-40-201ENST00000390299 407 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1273A-201ENST00000408826 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01219-201ENST00000418612 722 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPT-208ENST00000431008 1233 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162386.1-201ENST00000433817 645 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC119424.1-201ENST00000472513 350 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WASH6P-207ENST00000476066 720 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA50B-201ENST00000517198 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL929601.1-202ENST00000551067 418 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019294.2-201ENST00000565686 553 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133299.1-201ENST00000565968 507 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133561.3-201ENST00000568778 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010761.4-201ENST00000577325 521 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6511B1-201ENST00000612014 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV2-8-201ENST00000620395 517 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA50B-202ENST00000630737 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRX1-201ENST00000239461 4284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.2 ms