Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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BRD3Q15059 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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BRD3Q15059 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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BRD3Q15059 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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BRD3Q15059 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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BRD3Q15059 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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BRD3Q15059 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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