Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAN1Q9Y2M0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAN1Q9Y2M0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAN1Q9Y2M0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAN1Q9Y2M0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAN1Q9Y2M0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAN1Q9Y2M0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAN1Q9Y2M0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms