Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms