Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS5Q9UPZ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms