Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms