Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBE1Q9UJT0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms