Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCDC2Q9UHG0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms