Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPC1L1Q9UHC9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms