Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFIP11Q9UBB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms