Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRBP1Q9P2E9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms