Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMG20BQ9P0W2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMG20BQ9P0W2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms