Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP1Q9NZU7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms