Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms