Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms