Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms