Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms