Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRDM7Q9NQW5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms