Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC52A3Q9NQ40 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms