Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUFT1Q9NNX1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUFT1Q9NNX1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms