Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIAA1549Q9HCM3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms