Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ5

ZSWIM6, Zinc finger SWIM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM6Q9HCJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZSWIM6Q9HCJ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZSWIM6Q9HCJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms