Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00472Q9H8W2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms