Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1DQ9H5J8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms