Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD7BQ9C0I4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD7BQ9C0I4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms