Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL4Q9C0H6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL4Q9C0H6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms