Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms