Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms