Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms