Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRTQ9BXP5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRTQ9BXP5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms