Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms