Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms