Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CITED1Q99966 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CITED1Q99966 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CITED1Q99966 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CITED1Q99966 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CITED1Q99966 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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