Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms