Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD5Q99666 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms