Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRBNQ96SW2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms