Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCNAQ96QF7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCNAQ96QF7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms