Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms