Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CELF6Q96J87 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CELF6Q96J87 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms