Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4CQ96CF2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms