Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6Q969F1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms