Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL5Q93034 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms